煙氣在線監測系統里的采樣系統主要包含三級反滲透設備、冷卻器、伴熱管線、二級反滲透設備及其采樣探頭等構成部分，一旦采樣系統發生堵塞，就會造成采樣的總流量非常低，不良影響較為嚴重。
相關部門當發現采樣系統堵塞時，首先要確定堵塞實際位置，可采取以下措施：因為伴熱管線和采樣探頭通常都是在煙筒或是排煙道等距地面較高的地方，查驗不便，因此可以直接對剖析網絡機柜內部結構的三級反滲透設備、二級反滲透設備及其冷卻器等方面進行仔細的檢查。但是要求對網絡機柜運行檢查工作的人員具有很高的專業素養，一定要了解采樣系統，保證清查結論。